国民党"立法院"党团总召廖国栋认为，不管是"国歌""国旗"或"宪法层次的领土议题"，国民党过去以来都反对碰触，"这绝对会影响两岸关系"，若真发生，"你当家却闹事，跟我们没有关系"。国民党"立委"蒋万安表示，这次修法，民进党强行删除"领土变更"等议题，"神主牌都可以丢掉"，让民众看清楚"民进党是玩假的"。
台湾大学政治系教授张亚中认为，台湾以议会民主的"间接民权"为主、"公投"的"直接民权"为辅，与瑞士的直接民权为主不同，因此台湾本来的"公投"门槛较为严格。门槛一旦大降，可能造成彼此位阶混乱，"要听公投的，还是听议会的?"
张亚中说，以美猪议题为例，可能影响对外关系;若是"国歌"议题，涉及的则是认同问题，后者很难要少数去服从多数，"需要不断去讲理、沟通，要是一下子就拉到公投，就会造成社会分歧，也会失去审议式民主的运作空间"。
