至于更重大的"公投"挑战，郭正亮认为，是来自"独派"的"改国歌"提案，很可能冲击早已岌岌可危的两岸关系。郭正亮认为，"改国歌公投"并未直接变更"国号"或"领土主权"，但仍可视为进一步"去中国化"的标志
。一旦"独派"发动"改国歌公投"联署，郭正亮警告说，必将立刻触动两岸的最敏感神经，北京必做出激烈反应，对想要"稳住两岸现状，优先改善内政"的蔡英文当局来说，势将成为空前挑战。
郭正亮的担忧并非杞人忧天，亲绿的《自由时报》20日刊登的一篇评论印证了"独派"的蠢蠢欲动。这篇以"更改国号公投，取代统独公投"为题的文章称，即使"公投法"千辛万苦修正后，"统独公投"的举行，仍会面临来自中国大陆、美国等外界和台湾泛蓝的巨大阻力。也许退而求其次，采取"更改国号公投"，取代尖锐的"统独公投"，只讨论是否修改名称，却不碰触是否"独立"，会是较务实面的抉择。
